Dunajská delta je najväčším chráneným prírodným územím na Európskom kontinente a jeden z najlepšie zachovaných mokraďných regiónov v Európe a ako jediná delta na svete je celá deklarovaná ako biosférická rezervácia. Vyhlásenie Biosférickej rezervácie v roku 1990 je uznaním ako pre miestnych obyvateľov a ich tradičného spôsob života, založeného na bohatstve tohto územia, tak aj pre kultúrne dedičstvo rôznych etnických skupín.

Prírodná krajina, charakterizovaná originalitou a diverzitou, takmer neporušenou, skladajúca sa z mozaiky riečnych vetiev, kanálov, jazier rôznych typov a veľkostí, trstín, pieskových dún bukových lesov so stredomorskou vegetáciou a pláži, predstavuje hlavné hlavné turistické lákadlo Delty Dunaja.

Biodiverzita a ekosystémy Delty – Nádherné prírodné biotopy, ktoré sa tu vyvinuli, patria medi tie najrôznorodejšie v Rumunsku. Poskytujú vhodné podmienky pre impozantný počet druhov – žije tu okolo 7 400 druhov, z toho 2 383 zástupcov flóry a 4 029 fauny. V dunajskej delte bolo zaznamenaných 340 druhov vtákov, čo predstavuje asi 85% zo všetkých druhov pozorovaných v Rumunsku a 40% z druhov zaznamenaných v celej Európe. Podľa Bernskej konvencie je 320 z týchto druhov chránených (229 vtáčích druhov je zahrnutých v Annexe II – Striktne chránené živočíšne druhy a 91 druhov v Annexe III – Chránené živočíšne druhy) a podľa rumunského právneho rámca je 12 ohrozených druhov chránených ako “monumenty prírody”. Táto oblasť sa stala celosvetovo známou ako hniezdisko pre mnoho vtáčích populácií (viac ako 170 druhov), vrátane pelikána ružového, pelikána kučeravého, kormorána malého a pod.

V rámci Biosférickej rezervácie Delty Dunaja sa nachádza 30 typov ekosystémov – 23 prirodzených a 7 vytvorených človekom. Hlavné ekosystémy predstavujú: (reofilické) ekosystémy tečúcich vôd, pozostávajúce z vetví Dunaja a viacerých významnejších tokov a kanálov, v ktorých, okrem iných početných živočíchov, červov a slimákov, nachádza vhodné podmienky aj ichtyofauna, zastúpená kaprom obyčajným (Cyprinus carpio), zubáčom veľkoústym (Lucioperca lucioperca),sumcom obyčajným (Silurus glanis), atď. ako aj jesetermi – jeseter malý (Acipenser ruthenus), migrujúcim druhom ako je alóza pontická (Alosa pontica), morským jeseterom – vyzou veľkou (Huso huso). Ekosystémy stojatých vôd sú zastúpené najmä jazerami a sú typické hlavne bohatou podvodnou a plávajúcou flórou ako je kotvica plávajúca (Trapa natans), šípovka vodná (Sagittaria sagittifolia),a iné. Ekosystémom s močiarnymi a záplavovými oblasťami (trstín a plávajúcich trstinových ostrovčekov) dominuje hlavne trstina obyčajná (Phragmites communis). Unikátnymi miestami v tomtu ekosystéme sú pohybujúce sa trstinové ostrovčeky, ktoré sú tvorené zmesou trstinových podzemkov, trávovej vegetácie, organických a pôdnych zvyškov, a sú zvyčajne nestále.

Obzvlášť významnéčasti Delty Dunaja sú zapísané ako miesta komunitného významu – majúc v rámci Európskej ekologickej siete Natura 2000 29 typov biotopov špecifických pre bioregión stepí a 4 biotopy, špecifické pre čiernomorský bioregión.